Dans le cadre de leur activité conjointe de formation permanente en bioinformatique, l'université Joseph Fourier, le CEA Grenoble et l'INRIA Rhône-Alpes organisent une session de formation sur :

Bases de données et de connaissances biologiques - modélisation et opérationnalisation

du lundi 26 au vendredi 30 mars 2007, dans les salles d'informatique de l'UFR de biologie, université Joseph Fourier, Domaine universitaire de Saint-Martin d'Hères (Grenoble)

Objectif

Les programmes de recherche en génomique et post-génomique sont à la fois de gros consommateurs et de gros producteurs de données. La modélisation de ces données et des connaissances associées est essentielle à leur utilisation pertinente, notamment dans le cadre d'une démarche d'analyse automatique.

Durant cette semaine de formation, les différentes étapes menant de la conception d'un modèle de données à la réalisation d'une base de données le mettant en oeuvre seront abordées à la fois d'un point de vue théorique et pratique.

Aucun pré-requis n'est exigé pour suivre cette formation.

Public

Ingénieurs et chercheurs amenés à gérer et à analyser des données biologiques : séquences génomiques et leurs annotations, données d'expression, données protéomiques, etc.

Le nombre de participants est limité à 12.

Programme

La formation s'articule autour d'une série de cinq cours et d'un module de travaux pratiques où les participants développeront une base de données décrivant le réseau métabolique.

 Introduction aux concepts de représentation des données et des connaissances

 Modélisation UML

 Les bases de données relationnelles

 Le langage de requêtes SQL

 La gestion de la cohérence des données

Frais d'inscription

 Auditeurs du CEA, de l'Université Joseph Fourier ou de l'INRIA : 800 €

 Auditeurs extérieurs : 1300 €

Renseignements et inscriptions

Eric Coissac