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Analyse qualitative de la dynamique de r�seaux de r�gulation g�nique par des mod�les lin�aires par morceaux |
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Technique et Science Informatique (TSI), 26(1-2):11-45, 2007. |
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G. Batt, H. de Jong, J. Geiselmann, J.-L. Gouz�, M. Page, D. Ropers, T. Sari, D. Schneider |
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Le fonctionnement et le d�veloppement des organismes vivants sont contr�l�s par des r�seaux complexes de g�nes, prot�ines, petites mol�cules et leurs interactions, appel�s r�seaux de r�gulation g�nique. Nous discutons dans cette revue une m�thode de mod�lisation et de simulation qualitative de r�seaux de r�gulation g�nique, bien adapt�e au manque actuel de donn�es biologiques quantitatives et pr�cises. Cette m�thode est bas�e sur une classe d'�quations diff�rentielles lin�aires par morceaux (LPM) poss�dant des propri�t�s math�matiques favorables. Nous d�crivons quelques r�sultats de base concernant la dynamique de syst�mes LPM, introduisons une abstraction discr�te sur laquelle repose la m�thode de simulation qualitative et illustrons notre approche avec une application concernant la r�ponse au stress nutritionnel de la bact�rie Escherichia coli.
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