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What is bioinformatics? > A series of nine papers published (in French) by the Biofutur journal in 2005
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Editorial of the January 2005 issue of the Biofutur journal
La revue Biofutur publie un dossier sur la bioinformatique dans ses num�ros de janvier et f�vrier 2005
 

� - L'informatique n'est qu'un outil ! �

� travers cette affirmation p�remptoire, j'entends mon interlocuteur me signifier, outre la sup�riorit� �pist�mologique de sa discipline, le n�cessaire assujettissement de l'informatique aux besoins que lui et ses coll�gues sont amen�s � exprimer. Je ressens simultan�ment l'expression de sa conviction confiante que l'informatique saura toujours r�pondre � ces demandes, quelles qu'elles soient.

Le chercheur en informatique que je suis est tout d'abord tent� de r�torquer en expliquant les fondements de sa discipline scientifique et en pr�sentant les notions de syst�me formel, de compl�tude, de preuve, de calculabilit�, de complexit� et d'autres encore. Mais je prends vite conscience que je ne fais ainsi que r�v�ler le pu�ril sentiment de vexation que j'ai �prouv� et qu'une telle r�action serait finalement peu constructive. Je d�cide donc d'adopter une attitude plus positive.

L'informatique n'est qu'un outil, soit. Mon coll�gue se donne-t-il les moyens de choisir le logiciel le plus adapt� � chaque situation ? Mesure-t-il les limites de celui retenu souvent plus par habitude que par raison ? Est-il capable de relier la valeur d'un param�tre du programme � la pertinence des r�sultats produits par son ex�cution ? A-t-il conscience de la facilit� avec laquelle il est possible d'obtenir des r�sultats non significatifs, voire faux ? Prend-t-il soin, avant de lancer ses exp�riences, de v�rifier qu'il disposera des algorithmes et des logiciels adapt�s aux donn�es qu'elles vont produire et aptes � r�pondre � la probl�matique dans laquelle elles s'inscrivent ? Sait-il que, si ces algorithmes et ces logiciels n'existent pas, leur conception peut requ�rir un long travail de recherche au r�sultat non garanti ?

En d'autres termes, mon coll�gue apporte-t-il autant de consid�ration et de soin � l'outil informatique qu'il en apporte par ailleurs � l'ensemble de son dispositif d'investigation scientifique, en particulier exp�rimental ?

Fran�ois Rechenmann

Directeur de recherche

INRIA Rh�ne-Alpes (Institut de Recherche en Informatique et en Automatique)

 
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The abstracts of the papers (in French)
 
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