Annotation - Réannotation

Vendredi 7 novembre 2003

Salle 14, bâtiment des retrovirus

Institut Pasteur

Contact : Caroline Boursaux-Eude

 8h45 : Accueil

 9h00-9h20 : Le pourquoi de la journée et présentation des participants, tentative de définition de l'annotation, grandes étapes (Ivan Moszer et Caroline Boursaux-Eude)

 9h20-9h45 : Annotation et ré-annotation de génomes bactériens au sein de l'AGC (Claudine Médigue)

 9h45-10h05 : Annotation « maison » (Philippe Glaser)

 10h05-10h25 : Projets de ré-annotation des génomes de mollicutes à partir de l'outil MolliGene : présentation de l'outil puis résolution des problèmes d'homogénéisation de l'annotation et de la ré-annotation (Aurélien Barré et Pascal Sirand-Pugnet)

 10h25-10h45 : Annotation et ré-annotation chez Helicobacter (Ivo Gomperts Boneca)

Pause café 10h45-11h10

 11h10-11h30 : Ré-annotation chez les mycobactéries (Melinda Pryor)

 11h30-11h50 : Annotation et ré-annotation chez Bacillus anthracis (Maryse Moya-Nilges)

 11h50-12h10 : Outil d'annotation CAAT-BOX (Lionel Frangeul)

 12h10-12h30 : Annotation de génomes bactériens et outils spécifiques développés sur la plate-forme bioinformatique de la Génopole de Toulouse (Sébastien Carrère)

Déjeuner - buffet

 14h00-14h15 : Présentation de la plate-forme d'annotation procaryote de l'INRA de Jouy-en-Josas (Philippe Bessières)

 14h15-14h35 : Présentation de GenoAnnot (module de GenoStar) (Yves Vandenbrouck, GENOME express)

 14h35-14h55 : Quelques exemples d'utilisation de la plateforme GenoStar/GEB (Anne Morgat, Helix / Fondation Rhône-Alpes Futur / SIB)

 15h-16h30 : Discussion générale, définition d'une stratégie générale d'annotation/réannotation, projet commun ?

Café de fin de journée

 17h00 : Clôture de la journée